153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0437 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  100 
 
 
446 aa  892    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  44.47 
 
 
439 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  43.84 
 
 
444 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.27 
 
 
447 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  43.5 
 
 
437 aa  362  9e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  44.24 
 
 
446 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  42.63 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  42.03 
 
 
438 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  41.55 
 
 
440 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  37.81 
 
 
442 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  43.75 
 
 
447 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  37.13 
 
 
442 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  38.73 
 
 
441 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.63 
 
 
451 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  35.41 
 
 
448 aa  276  5e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.72 
 
 
432 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  33.71 
 
 
440 aa  263  4e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  35.79 
 
 
445 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  33.18 
 
 
437 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.09 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.26 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.26 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.64 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.41 
 
 
433 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.41 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.41 
 
 
433 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.04 
 
 
453 aa  232  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.18 
 
 
433 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.18 
 
 
433 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.4 
 
 
427 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  34.17 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.17 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.17 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.69 
 
 
428 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.57 
 
 
428 aa  225  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.09 
 
 
435 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.18 
 
 
433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.09 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.64 
 
 
428 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.64 
 
 
428 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  33.18 
 
 
427 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  33.41 
 
 
427 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.18 
 
 
427 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.18 
 
 
427 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.86 
 
 
435 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.95 
 
 
440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.77 
 
 
435 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.5 
 
 
427 aa  216  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.14 
 
 
434 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.07 
 
 
435 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  29.07 
 
 
435 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  31.35 
 
 
582 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.84 
 
 
435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  29.07 
 
 
435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.33 
 
 
451 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.93 
 
 
439 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.9 
 
 
434 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  28.9 
 
 
434 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.26 
 
 
433 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  29.89 
 
 
570 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  29.89 
 
 
570 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  32.04 
 
 
433 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1618  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.49 
 
 
437 aa  204  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.25 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.52 
 
 
568 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  32.16 
 
 
440 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.37 
 
 
434 aa  193  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.66 
 
 
420 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.96 
 
 
436 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.96 
 
 
436 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.96 
 
 
436 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.96 
 
 
436 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.96 
 
 
436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.96 
 
 
436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.73 
 
 
436 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.96 
 
 
436 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.73 
 
 
436 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.57 
 
 
494 aa  180  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.91 
 
 
448 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  26.08 
 
 
546 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.65 
 
 
445 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0199  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.84 
 
 
439 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  27.9 
 
 
441 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.33 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.29 
 
 
439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0195  cellobiose-specific PTS system IIC component  27.59 
 
 
476 aa  173  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0622401  normal  0.284293 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  26.54 
 
 
450 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0501  cellobiose-specific PTS system IIC component  25.41 
 
 
565 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0468  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.55 
 
 
445 aa  166  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0221  cellobiose phosphotransferase system IIC component  26.8 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.719758  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1430  cellobiose-specific PTS system IIC component  33.77 
 
 
333 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000729794  normal  0.124134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.72 
 
 
445 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  25.63 
 
 
438 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1707  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  31.08 
 
 
452 aa  160  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.23 
 
 
437 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  27.88 
 
 
440 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.47 
 
 
437 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1410  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  28.57 
 
 
452 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  0.0748148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1858  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  28.57 
 
 
452 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.98931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2031  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  28.57 
 
 
452 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>