239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1019 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  64.04 
 
 		 496 aa  683    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  100 
 
 		 508 aa  1069    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  54.62 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  52.54 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  45.47 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  45.25 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  44.89 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  45.07 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  45.07 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  44.83 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  45.83 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  43.49 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  45.22 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  43.09 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  46.34 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  44.51 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  43.15 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  43.63 
 
 		 493 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  43.03 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  43.7 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  40.46 
 
 		 487 aa  351  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  41.16 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  40.16 
 
 		 522 aa  341  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  40.22 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  39.56 
 
 		 472 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  42.54 
 
 		 474 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  39.38 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  41.87 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.13 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  38.44 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  38 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  38.91 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  39.78 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  38.29 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  39.78 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  39.43 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  38.27 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  38.32 
 
 		 469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  38.34 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  35.18 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  40.53 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  38.01 
 
 		 460 aa  286  7e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  38.39 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  38.04 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  34.97 
 
 		 462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  37.2 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  38.57 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  38.04 
 
 		 469 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  35.88 
 
 		 469 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  38.27 
 
 		 469 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  37.78 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  36.47 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  38.34 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  36.59 
 
 		 471 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  37.08 
 
 		 466 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  36.25 
 
 		 465 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.68 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  37.08 
 
 		 465 aa  276  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  37.33 
 
 		 462 aa  276  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  35.24 
 
 		 470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  37.44 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  37.44 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  35.45 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  34.97 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  35.45 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  36.32 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  37.92 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  36.51 
 
 		 469 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  36.28 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  36.89 
 
 		 463 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  36.28 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  36.88 
 
 		 470 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  37.33 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  35.53 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.52 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  36.5 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  35.95 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  38.57 
 
 		 473 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  35.84 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  35.29 
 
 		 473 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.98 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  37.02 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  35.27 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  34.29 
 
 		 491 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.88 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  37.02 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.36 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  34.42 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  34.45 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  35.51 
 
 		 463 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  36.75 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  37.08 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  35.07 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  35.09 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  34.93 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  32.79 
 
 		 465 aa  233  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  32.86 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  34.58 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  34.56 
 
 		 481 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  32.91 
 
 		 476 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>