230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0789 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  69.86 
 
 		 491 aa  701    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  100 
 
 		 490 aa  1009    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  58.28 
 
 		 498 aa  579  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  51.63 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  52.04 
 
 		 487 aa  488  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  50.74 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  48.57 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  48.33 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1198  threonine synthase  46.84 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.823792  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0903  threonine synthase  46.23 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  46.23 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  38.14 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  39.37 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  39.96 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  40.62 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  37.08 
 
 		 498 aa  316  8e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  38.28 
 
 		 499 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  37.7 
 
 		 522 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  39.06 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  36.97 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  36.85 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  38.59 
 
 		 497 aa  300  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  37.14 
 
 		 487 aa  299  6e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  37.71 
 
 		 496 aa  299  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  36.66 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  37.88 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  38.41 
 
 		 490 aa  295  9e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  36.51 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  36.63 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  34.79 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  35.74 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  36.25 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.96 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  34.83 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  35.35 
 
 		 470 aa  263  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  34.61 
 
 		 471 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  35.67 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  33.69 
 
 		 458 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  35.12 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  34.39 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  32.73 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  33.9 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  35.52 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  35.36 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  34.91 
 
 		 471 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  34.44 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  34.38 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  33.4 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  35.8 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  34.67 
 
 		 453 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  33.6 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  35.49 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  34.42 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  35.8 
 
 		 472 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  33.81 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  34.76 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  34.76 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  33.75 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  34.91 
 
 		 468 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  33.33 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  32.81 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  33.48 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  33.94 
 
 		 460 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  33.54 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  33.33 
 
 		 469 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  33.54 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  33.54 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  33.12 
 
 		 469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  33.85 
 
 		 467 aa  243  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  34.76 
 
 		 467 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  33.05 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  33.93 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  36.28 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  33.41 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  33.93 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  33.41 
 
 		 471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  34.71 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  34.82 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  32.92 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  33.86 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  32.96 
 
 		 466 aa  239  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  33.05 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  32.81 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  32.78 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  34.68 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  34.4 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  34.24 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  32.57 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  33.56 
 
 		 469 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  35.04 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  34.57 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  31.93 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  33.56 
 
 		 469 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  34.74 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  32.37 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  34.38 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  33.96 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  32.96 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  32.42 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  32.95 
 
 		 466 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>