234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1198 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0903  threonine synthase  96.38 
 
 
470 aa  923    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  96.81 
 
 
470 aa  927    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1198  threonine synthase  100 
 
 
470 aa  951    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.823792  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  59.62 
 
 
469 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  54 
 
 
487 aa  511  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  55.09 
 
 
580 aa  514  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  53.86 
 
 
476 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  53.48 
 
 
487 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  46.73 
 
 
491 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  46.73 
 
 
498 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  46.84 
 
 
490 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  39.51 
 
 
493 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  37.18 
 
 
487 aa  270  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  36.65 
 
 
500 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  35.14 
 
 
516 aa  260  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  35.78 
 
 
522 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  34.43 
 
 
485 aa  257  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  37.89 
 
 
497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  33 
 
 
494 aa  250  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  36.46 
 
 
499 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  34.43 
 
 
495 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  34.22 
 
 
507 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  32.47 
 
 
500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  32.82 
 
 
499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  33.06 
 
 
496 aa  243  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  34.11 
 
 
490 aa  243  7.999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  33.62 
 
 
499 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  31.08 
 
 
498 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  33.49 
 
 
502 aa  237  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  34.6 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  34 
 
 
496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  35.42 
 
 
460 aa  229  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  35.52 
 
 
499 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  33.72 
 
 
460 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.94 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  33.1 
 
 
472 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  32.88 
 
 
469 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  32.64 
 
 
462 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  33.56 
 
 
462 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  32.26 
 
 
471 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  33.11 
 
 
453 aa  223  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  33.17 
 
 
460 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  32.1 
 
 
461 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  32.87 
 
 
472 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  32.72 
 
 
469 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  31.95 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  32.64 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  31.79 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  32.1 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  34.16 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  31.87 
 
 
461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  32.11 
 
 
470 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  32.49 
 
 
469 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  32.64 
 
 
468 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  33.41 
 
 
465 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  32.88 
 
 
469 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  32.88 
 
 
469 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  33.18 
 
 
469 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  32.04 
 
 
469 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  30.92 
 
 
504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  32.25 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  31.64 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  32.65 
 
 
469 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  31.26 
 
 
463 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  32.12 
 
 
470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  32.48 
 
 
463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  32.04 
 
 
469 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  32.49 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  32.46 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  31.89 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  32.42 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  32.74 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  30.56 
 
 
461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  30.49 
 
 
496 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  31.25 
 
 
472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  32.27 
 
 
463 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  32.27 
 
 
463 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  32.27 
 
 
473 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  30.96 
 
 
470 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  31.94 
 
 
511 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  30.77 
 
 
471 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  31.32 
 
 
465 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  33.49 
 
 
461 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  30.09 
 
 
471 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  31.33 
 
 
547 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  30.95 
 
 
462 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  32.1 
 
 
458 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  30.18 
 
 
474 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  31.38 
 
 
470 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  31.18 
 
 
458 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  30.87 
 
 
466 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  29.98 
 
 
471 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  32.02 
 
 
465 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  31.02 
 
 
469 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  32.4 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  30.37 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  31.42 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  29.59 
 
 
465 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  30.99 
 
 
504 aa  199  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  30.41 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>