248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0539 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  100 
 
 		 502 aa  1043    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  57 
 
 		 490 aa  548  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  53.2 
 
 		 496 aa  528  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  52.54 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  47.28 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  48.15 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  45.58 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  45.6 
 
 		 500 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  45.6 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  46.09 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  47.08 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  44.49 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  47.23 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  45.16 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  44.89 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  45.58 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  46.15 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  44.24 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  42.28 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  42.02 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  40.81 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  43.71 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  43.89 
 
 		 522 aa  342  9e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  39.96 
 
 		 504 aa  336  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  41.04 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  41.12 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  38.32 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  37.55 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  40.59 
 
 		 472 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  40.14 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  39.91 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  40.36 
 
 		 472 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  40.45 
 
 		 476 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  39.23 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  39.23 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  40.31 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  39.32 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  39.86 
 
 		 471 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  38.38 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  39.23 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  36.63 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  38.37 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  37 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  34.73 
 
 		 498 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  37.16 
 
 		 469 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  38.41 
 
 		 463 aa  282  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  38.41 
 
 		 463 aa  282  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  36.93 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  36.77 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  37.35 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  37.92 
 
 		 465 aa  279  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  38.78 
 
 		 463 aa  279  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  36.91 
 
 		 466 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  36.22 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  38.93 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  36.47 
 
 		 469 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  37.72 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  37.66 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  38.1 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  37.56 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  38.95 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  37.27 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  38.01 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  40.05 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  36.96 
 
 		 461 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  36.73 
 
 		 461 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  37.25 
 
 		 461 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  35.55 
 
 		 469 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  35.78 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  37.27 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  35.55 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  35.32 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  37.64 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  35.96 
 
 		 511 aa  266  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  38.32 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  36.66 
 
 		 487 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  37.36 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.45 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  36.22 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  38.44 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  35.99 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  37.84 
 
 		 487 aa  260  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  36.63 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  35.36 
 
 		 491 aa  259  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  36.2 
 
 		 463 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  37.41 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  37.87 
 
 		 462 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  36.71 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  36.88 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  35.69 
 
 		 547 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  35.89 
 
 		 517 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  36.36 
 
 		 458 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  35.57 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  35.68 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  36.45 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  33.73 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  35.57 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  35.7 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  37.58 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0833  threonine synthase  33.94 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>