More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0148 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 		 486 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  79.87 
 
 		 493 aa  781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  71.65 
 
 		 481 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  70.75 
 
 		 482 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  73.46 
 
 		 479 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 		 485 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  72.52 
 
 		 478 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.56 
 
 		 480 aa  693    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 495 aa  1009    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  77.96 
 
 		 493 aa  779    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  69.14 
 
 		 482 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  73.99 
 
 		 480 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  69 
 
 		 477 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.15 
 
 		 478 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.37 
 
 		 486 aa  723    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  70.79 
 
 		 477 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.07 
 
 		 479 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.56 
 
 		 517 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  69 
 
 		 486 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  70.92 
 
 		 476 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.25 
 
 		 484 aa  700    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.36 
 
 		 509 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  78.53 
 
 		 493 aa  797    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.48 
 
 		 486 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.88 
 
 		 491 aa  765    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 		 476 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.34 
 
 		 490 aa  909    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  74.11 
 
 		 495 aa  711    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  72.01 
 
 		 472 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  70.88 
 
 		 475 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.19 
 
 		 484 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.62 
 
 		 493 aa  779    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.34 
 
 		 485 aa  685    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.21 
 
 		 490 aa  702    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.77 
 
 		 484 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 		 479 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.36 
 
 		 509 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.29 
 
 		 475 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.97 
 
 		 473 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.82 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.03 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.82 
 
 		 468 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.61 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.61 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  66.1 
 
 		 471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.68 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 		 470 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 		 470 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.77 
 
 		 470 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.17 
 
 		 475 aa  591  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 465 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  64.07 
 
 		 467 aa  588  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  63.24 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.68 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.44 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 		 468 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.08 
 
 		 468 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  61.86 
 
 		 464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  62.71 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  61.44 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.36 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.91 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.29 
 
 		 503 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  62.05 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  60.59 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.18 
 
 		 467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.36 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  62.63 
 
 		 470 aa  568  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.83 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.3 
 
 		 483 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.05 
 
 		 475 aa  571  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.3 
 
 		 483 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.52 
 
 		 487 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.09 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.09 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  58.45 
 
 		 479 aa  565  1e-160  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.09 
 
 		 484 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  62.29 
 
 		 485 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.51 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.44 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.36 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  58.94 
 
 		 465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.76 
 
 		 475 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.13 
 
 		 476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.04 
 
 		 471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.1 
 
 		 476 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.34 
 
 		 466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.79 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.04 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.04 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>