More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0142 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  57.71 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  48.09 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  46.01 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  45.91 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  45.24 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  41.43 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  40.57 
 
 		 283 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.86 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  38.96 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  33.21 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  31.73 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  37.68 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  31.82 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  36.74 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  30.55 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  30.97 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  34.07 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.14 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  36.12 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  31.71 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  30.49 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  28.35 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  32.44 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.62 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.2 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  32.03 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  38.05 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  30.9 
 
 		 207 aa  95.9  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  32.03 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  28.63 
 
 		 364 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  26.47 
 
 		 338 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  34.35 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  31.53 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  35.51 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  28.91 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  31.52 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  33.94 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  31.56 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  29.8 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  27.11 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  29.44 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  31.2 
 
 		 391 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  32.76 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  34.82 
 
 		 249 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  32.9 
 
 		 406 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  34.7 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.01 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  28.74 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.83 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  31.84 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  28.45 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  24.9 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  30.74 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  27.69 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  36.02 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  30.2 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  32.16 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  28.69 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  32.14 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  32.18 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  29.53 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  27.94 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  31.76 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  32.86 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  32.11 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  31.94 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  26.57 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  28.32 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  29.49 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  27.31 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>