More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0032 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  100 
 
 		 488 aa  996    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  62.91 
 
 		 488 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  41.99 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.7 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.88 
 
 		 489 aa  355  6.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.87 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.73 
 
 		 485 aa  349  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 		 480 aa  349  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.63 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  39.55 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  42 
 
 		 489 aa  334  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.72 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  39.88 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.96 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.41 
 
 		 487 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.87 
 
 		 485 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  39 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.2 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.72 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  39 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.95 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  37 
 
 		 491 aa  294  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.03 
 
 		 481 aa  292  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 		 484 aa  282  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 		 486 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  37.09 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.67 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 		 482 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  38.21 
 
 		 489 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 		 501 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 503 aa  256  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  35.43 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.54 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.19 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.32 
 
 		 921 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  34.38 
 
 		 933 aa  217  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  32.53 
 
 		 471 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 473 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.39 
 
 		 972 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 503 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 570 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 924 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 547 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.22 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 954 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 584 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  30.36 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 578 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.54 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 		 573 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 		 646 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 		 645 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  33.42 
 
 		 646 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.77 
 
 		 610 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.69 
 
 		 701 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.99 
 
 		 646 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.99 
 
 		 641 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 643 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.12 
 
 		 586 aa  156  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.29 
 
 		 611 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 597 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 547 aa  152  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.05 
 
 		 711 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.52 
 
 		 640 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  32.49 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 582 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.12 
 
 		 629 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  29.41 
 
 		 626 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30.84 
 
 		 617 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.38 
 
 		 629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  32.74 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 		 617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 673 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>