More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3310 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  72.4 
 
 		 192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2377  Methyltransferase type 11  65.79 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.954171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1842  Methyltransferase type 11  66.32 
 
 		 190 aa  278  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  49.48 
 
 		 190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3127  methyltransferase type 11  48.4 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4456  methyltransferase type 12  46.15 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2245  Methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 244 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3326  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  27.22 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2464  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2146  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1867  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000037556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.1 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4679  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0330  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  26.24 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  28.74 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.69 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  27.68 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.14 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 265 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.19 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 		 434 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 		 300 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  29.51 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.48 
 
 		 304 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 337 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  30 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.07 
 
 		 300 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 397 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.17 
 
 		 318 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 415 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.72 
 
 		 303 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  31.69 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.51 
 
 		 295 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.9 
 
 		 403 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 245 aa  51.2  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3707  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0604  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.11 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.3 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32.17 
 
 		 355 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 		 1171 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.99 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.07 
 
 		 302 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.48 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  29.91 
 
 		 360 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.03 
 
 		 403 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 277 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>