31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2071 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 757 aa  1521    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 665 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  44.88 
 
 		 626 aa  277  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  41.81 
 
 		 611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  61 
 
 		 627 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  60 
 
 		 635 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  32.16 
 
 		 846 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 974 aa  148  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 883 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 893 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 878 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 900 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.01 
 
 		 870 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.84 
 
 		 1737 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.26 
 
 		 3145 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 884 aa  49.3  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.79 
 
 		 818 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 457 aa  48.5  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 567 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.04 
 
 		 1056 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1090 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 1069 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.46 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0228  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 467 aa  45.8  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.390102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.15 
 
 		 810 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1092 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.16 
 
 		 1056 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 622 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.06 
 
 		 1003 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>