34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1690 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  797    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1978  LPS biosynthesis protein WbpG  77.37 
 
 		 380 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3122  LPS biosynthesis protein WbpG  42.78 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3091  ExsB family protein  38.14 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2425  PP-loop domain-containing protein  35.39 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.282711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0185  hypothetical protein  23.4 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2382  hypothetical protein  35.66 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20141  hypothetical protein  38 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3933  putative LPS biosynthesis protein  23.32 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0710659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0165  hypothetical protein, putative pseudaminic acid biosynthesis protein  35.77 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0258  putative outer membrane protein  35.77 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0268  hypothetical protein  22.4 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2049  PP-loop  26.43 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0673  LPS biosynthesis protein  25.07 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1328  pseudaminic acid biosynthesis protein PseA  34.17 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0537104  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0398  flagellin modification protein, PseA  32.5 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.87492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1333  flagellin modification protein, PseA  31.67 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1511  flagellin modification protein, PseA  31.67 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2392  LPS biosynthesis protein  25.18 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0225  putative ATP binding related protein  22.57 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1529  putative ATP binding related protein  27.68 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.961589  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0913  putative ATP binding related protein  21.62 
 
 		 291 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3936  LPS biosynthesis protein WbpG  30.43 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.074215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1687  putative ATP binding related protein  27.68 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14311  hypothetical protein  24.24 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08711  hypothetical protein  27.97 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.484525  unclonable  0.0000000933108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0530  LPS biosynthesis protein, PseA-like protein  34.62 
 
 		 440 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0107951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  26.23 
 
 		 2142 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1603  hypothetical protein  24.58 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14951  hypothetical protein  26.8 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0184708 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  27.01 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0785  hypothetical protein  28.7 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0814  hypothetical protein  28.7 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>