28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0921 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3233  cytochrome c family protein  42.48 
 
 		 1067 aa  730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0173325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3102  PKD domain containing protein  40.66 
 
 		 1132 aa  741    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0921  hypothetical protein  100 
 
 		 1160 aa  2388    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0919  PKD domain-containing protein  82.69 
 
 		 1023 aa  337  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3106  PKD domain containing protein  34.8 
 
 		 989 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3228  cytochrome c family protein  33.55 
 
 		 991 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.15 
 
 		 1565 aa  65.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  30.46 
 
 		 1150 aa  54.7  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  26.63 
 
 		 848 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  32.08 
 
 		 778 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  36.36 
 
 		 778 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  36.36 
 
 		 778 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  36.36 
 
 		 778 aa  52  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.88 
 
 		 816 aa  51.6  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  42.47 
 
 		 712 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  34.39 
 
 		 998 aa  48.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1916 aa  47.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  24.74 
 
 		 1057 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  27.13 
 
 		 623 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  31.41 
 
 		 775 aa  45.8  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  30 
 
 		 400 aa  45.8  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  52.08 
 
 		 884 aa  45.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.76 
 
 		 677 aa  45.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.53 
 
 		 3197 aa  45.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  42.42 
 
 		 938 aa  45.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  44.83 
 
 		 873 aa  45.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 944 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>