34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0488 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  54.21 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  52.11 
 
 		 187 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  51.87 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  49.39 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  43.98 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  42.7 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  46.56 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  37.75 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  36.31 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  31.4 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  36.81 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  32.7 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  32.97 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  29.56 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  29.23 
 
 		 465 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  29.08 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  29.68 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  33.08 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  31.91 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  29.08 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  25.93 
 
 		 484 aa  55.1  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  30.57 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  28.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  27.86 
 
 		 397 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  29.01 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  24.74 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  25.95 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.47 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  25.81 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.52 
 
 		 383 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  33.68 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3698  hypothetical protein  29.52 
 
 		 517 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>