96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4230 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  100 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  70.67 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  58.11 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  71.67 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  76.67 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  61.11 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  68.33 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  68.33 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  68.33 
 
 		 92 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  59.72 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  54.32 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  62.32 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  62.71 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  62.71 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  61.11 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  62.12 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  66.13 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  62.71 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  62.5 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  61.02 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  65 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  55.41 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  57.58 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  59.32 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  57.33 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  57.14 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  55.56 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  36.71 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  44.23 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  42.37 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  32.98 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  40.58 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  36.62 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 213 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  39.62 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  44.26 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  39.66 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  52.5 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  37.93 
 
 		 112 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  40.91 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  47.06 
 
 		 87 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  45.76 
 
 		 85 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 125 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  40.58 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 105 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  47.46 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  38 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  40 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  40 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  37.74 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  34.62 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  34.62 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  38.46 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  34.62 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  34.62 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  38.03 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  38 
 
 		 176 aa  40  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  34.62 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  48 
 
 		 82 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  34.62 
 
 		 84 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  39.78 
 
 		 122 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>