38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3879 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  769    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  38.86 
 
 		 398 aa  192  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 421 aa  130  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2441  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2447  major facilitator superfamily transporter  36.31 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2400  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  29.02 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  31.48 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  28.94 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  29.41 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2837  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 539 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 443 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  28.41 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>