56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3505 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  100 
 
 		 306 aa  577  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  57.79 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  49.32 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  47.68 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  45.78 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  48.33 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  39.68 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  32.25 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  38.59 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  38.36 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  29.53 
 
 		 371 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  28.45 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  33.13 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  30.24 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  30.33 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  24.29 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  27.78 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  36.32 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  25.67 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  23.84 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.83 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  32.12 
 
 		 371 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  29.97 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  29.97 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  29.97 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  37.4 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  25.08 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  33.52 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  32.07 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.87 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.36 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  25.82 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 365 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  31.16 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  31.29 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.92 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  28.78 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  37.68 
 
 		 392 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.5 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 382 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  27.03 
 
 		 404 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  29.24 
 
 		 652 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  28.29 
 
 		 413 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>