289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2056 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  100 
 
 
532 aa  1030    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  58.29 
 
 
559 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  59.06 
 
 
555 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  58.87 
 
 
548 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  55.81 
 
 
534 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  58.35 
 
 
538 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  56.36 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  57.49 
 
 
544 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  54.28 
 
 
555 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  52.36 
 
 
547 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.27 
 
 
542 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  52.12 
 
 
543 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  55.68 
 
 
542 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 
545 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  53.44 
 
 
533 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  48.94 
 
 
580 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  41.88 
 
 
541 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.66 
 
 
948 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.55 
 
 
950 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.46 
 
 
940 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.92 
 
 
955 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.35 
 
 
941 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.35 
 
 
941 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.84 
 
 
948 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.11 
 
 
950 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.74 
 
 
950 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.7 
 
 
958 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.35 
 
 
950 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  39.02 
 
 
920 aa  256  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.75 
 
 
632 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.56 
 
 
950 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.77 
 
 
552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.65 
 
 
943 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.19 
 
 
942 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.7 
 
 
965 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.61 
 
 
940 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  32.61 
 
 
568 aa  236  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.61 
 
 
572 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  32.69 
 
 
577 aa  210  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  31.17 
 
 
401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 
406 aa  103  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 
405 aa  103  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  30.96 
 
 
405 aa  99  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  27.45 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  28.15 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  27.52 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  27.17 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  31.01 
 
 
422 aa  90.9  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  29.07 
 
 
452 aa  90.5  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  25.38 
 
 
450 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  24.23 
 
 
450 aa  89.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  29.3 
 
 
468 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 
450 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 
450 aa  87.4  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  26.28 
 
 
443 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  26.28 
 
 
443 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 
441 aa  86.7  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  33.79 
 
 
525 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  25.77 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
528 aa  84  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  24.53 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  24.08 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  24.11 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  26.92 
 
 
449 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  25.58 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  23.85 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  33.21 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  28.29 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  27.31 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  31.09 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  24.56 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  28.24 
 
 
443 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  30.84 
 
 
529 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  23.68 
 
 
448 aa  80.1  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  24.81 
 
 
449 aa  80.1  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  28.24 
 
 
443 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  25.63 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  30.87 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  33.48 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  22.8 
 
 
443 aa  77  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  27.55 
 
 
448 aa  77  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  26.88 
 
 
457 aa  76.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  28.14 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  32.56 
 
 
526 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  24.38 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  34.21 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  22.92 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  29.34 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  31.63 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  26.14 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  26.88 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  25.19 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  24.18 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  23.14 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>