47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1078 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  100 
 
 		 56 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  62.5 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  57.14 
 
 		 57 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  63.46 
 
 		 56 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  55.36 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  65.38 
 
 		 57 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  60.71 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  60.71 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  60.71 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  63.46 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  61.54 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  65.38 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  58.73 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  63.46 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  57.69 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  53.57 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  55.77 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  48.21 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  52.73 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  48.08 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  51.79 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  51.79 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  48.08 
 
 		 58 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  51.02 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  50 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  50 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  48.08 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  54 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  50 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  46.15 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  48.15 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  54.35 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  45.1 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  36.54 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  36.54 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  48.98 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  46.43 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  46.15 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  48.98 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  42.31 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  43.64 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  39.22 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3392  hypothetical protein  45.76 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0935908  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  44.23 
 
 		 63 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  40.38 
 
 		 72 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>