235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0515 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 157 aa  307  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  64.97 
 
 		 152 aa  200  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  72.14 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  67.79 
 
 		 151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  72.14 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  72.14 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  75.33 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  74.5 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  68.39 
 
 		 157 aa  190  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  67.76 
 
 		 153 aa  190  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  60.62 
 
 		 177 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  68.35 
 
 		 162 aa  181  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  66.88 
 
 		 152 aa  179  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  62.25 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  64.9 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  62.59 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  68.79 
 
 		 152 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  64.96 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  58.67 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  63.69 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  60.93 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  69.18 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  67.81 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  57.33 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  61.78 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  64.63 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  62.67 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  60.4 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  64.34 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  64.19 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  64.63 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  68.71 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 189 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  61.64 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  65.97 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  54.3 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  50.98 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  49.34 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  49.34 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  54.97 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  52.45 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  47.47 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  48.08 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  47.44 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  51.92 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  52.98 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  45.81 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  48.68 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  62.42 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  47.71 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  47.71 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  50.99 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  49.32 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  47.95 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  49.32 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  47.26 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  62.82 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  41.98 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  45.95 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>