More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3407 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
287 aa  584  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  91.29 
 
 
287 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  81.53 
 
 
287 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.7 
 
 
287 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  77.35 
 
 
287 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  76.04 
 
 
288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.4 
 
 
288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.1 
 
 
288 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.86 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.86 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.79 
 
 
290 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.79 
 
 
290 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.25 
 
 
289 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.38 
 
 
290 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.86 
 
 
290 aa  268  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.13 
 
 
283 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.69 
 
 
281 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.6 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  46.08 
 
 
293 aa  261  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  46.08 
 
 
297 aa  260  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.9 
 
 
291 aa  258  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  47.28 
 
 
294 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.23 
 
 
291 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  47.1 
 
 
295 aa  255  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.05 
 
 
291 aa  254  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.1 
 
 
283 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  44.74 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  44.69 
 
 
305 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  45.7 
 
 
292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.42 
 
 
290 aa  251  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.92 
 
 
292 aa  251  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.96 
 
 
298 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.39 
 
 
282 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  42.41 
 
 
286 aa  248  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  43.79 
 
 
294 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  42.94 
 
 
345 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 
293 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 
290 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
289 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.39 
 
 
298 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.9 
 
 
294 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.8 
 
 
296 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 
299 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  40.69 
 
 
289 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
291 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.78 
 
 
295 aa  234  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  46.42 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.23 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  42.47 
 
 
295 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.95 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.14 
 
 
290 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  41.87 
 
 
290 aa  230  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.42 
 
 
294 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
293 aa  228  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.28 
 
 
294 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.15 
 
 
289 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  41.67 
 
 
285 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.92 
 
 
292 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
292 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.99 
 
 
290 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.25 
 
 
290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  41.73 
 
 
291 aa  224  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.77 
 
 
291 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.61 
 
 
295 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  42.91 
 
 
287 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.33 
 
 
290 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.58 
 
 
290 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.12 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.78 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
292 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
291 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  45.58 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.82 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
288 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.79 
 
 
296 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
288 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.11 
 
 
296 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
286 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
286 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
286 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.67 
 
 
286 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  41.64 
 
 
287 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.73 
 
 
302 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  39.81 
 
 
315 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.64 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.84 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.84 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.32 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>