More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3302 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  96.68 
 
 		 391 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  100 
 
 		 391 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  72.38 
 
 		 391 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  71.1 
 
 		 391 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  70.33 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  69.31 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  66.5 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  66.24 
 
 		 391 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  52.58 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  52.32 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  52.06 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  52.32 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  52.06 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  50.52 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.39 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  48.19 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  49.23 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  49.48 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  48.34 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  48.84 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0278  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.45 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000883017  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  47.57 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  48.08 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.87 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.59 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  48.71 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  48.97 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01744  acetoacetyl-CoA thiolase  51.92 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.569718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.49 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  50.9 
 
 		 393 aa  362  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.85 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  48.59 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 396 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 393 aa  359  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 		 393 aa  358  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 396 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0781  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.8 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4561  thiolase  49.1 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4665  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226383  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1331  acetyl-CoA acetyltransferases  51.66 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.33 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  48.59 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.71 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3164  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.783453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.85 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2955  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 391 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000192341  hitchhiker  0.000874312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>