199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2647 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  62.8 
 
 		 208 aa  272  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  37.09 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.18 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  42.57 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  41.58 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  35.24 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  44.23 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  38.61 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  30.45 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  40.59 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  39.17 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.57 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  28.87 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  34.35 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  29.72 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0022  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  40.4 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.17 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  30.26 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  29.76 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  32.33 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  34.45 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  29.58 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  30.57 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 		 178 aa  62  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  27.35 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  31.97 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.23 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.05 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  30.72 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  25.35 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  34.17 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  28.78 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  26.57 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  31.67 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  27.22 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  32.23 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  25.23 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  25.73 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  30.18 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>