22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2156 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1120    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  51.43 
 
 		 578 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  40.92 
 
 		 645 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  40.81 
 
 		 649 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  40.64 
 
 		 649 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  30.7 
 
 		 969 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  31 
 
 		 559 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  30.99 
 
 		 897 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  29.84 
 
 		 881 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 589 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  26.93 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  26.65 
 
 		 643 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  24.9 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  25.13 
 
 		 1062 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  25.94 
 
 		 841 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  25 
 
 		 1158 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  24.13 
 
 		 1069 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  26.36 
 
 		 1107 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.57 
 
 		 806 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  24.27 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  24.27 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.89 
 
 		 712 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>