35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3409 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  100 
 
 		 430 aa  885    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  62.13 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  62.03 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  58.8 
 
 		 416 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  59.47 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  24.54 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  22.54 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  26.06 
 
 		 870 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  28 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  29.6 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  23.24 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  24.21 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.77 
 
 		 553 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  25.7 
 
 		 1222 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1224 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  27.32 
 
 		 637 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.64 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  24.88 
 
 		 1223 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  24.49 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3276  hypothetical protein  25.2 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  26.88 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  32.28 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  27.27 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.63 
 
 		 560 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  25.93 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  20.77 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  26.83 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  31.51 
 
 		 780 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  26.62 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  24.14 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  23.62 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  26.76 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  23.27 
 
 		 886 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  38.95 
 
 		 587 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  26.4 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>