More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3171 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  76.04 
 
 
287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.65 
 
 
287 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.36 
 
 
287 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.18 
 
 
288 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.14 
 
 
287 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.44 
 
 
287 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.14 
 
 
288 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.2 
 
 
288 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.2 
 
 
288 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.14 
 
 
290 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.14 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.28 
 
 
289 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.92 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.83 
 
 
290 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
295 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  45.36 
 
 
292 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
291 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.88 
 
 
281 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.22 
 
 
283 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 
291 aa  255  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  45.76 
 
 
297 aa  254  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.67 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  43.83 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  42.24 
 
 
345 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  43.45 
 
 
294 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.71 
 
 
292 aa  252  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  42.43 
 
 
309 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.18 
 
 
290 aa  249  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  44.37 
 
 
295 aa  248  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  45.05 
 
 
294 aa  248  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  41.98 
 
 
293 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  41.24 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.96 
 
 
289 aa  242  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 
282 aa  241  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 
293 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.27 
 
 
296 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.02 
 
 
291 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.52 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  45.95 
 
 
292 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  40 
 
 
289 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
299 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.1 
 
 
295 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.1 
 
 
290 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.36 
 
 
298 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.18 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.67 
 
 
298 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.79 
 
 
290 aa  231  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.58 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.28 
 
 
296 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 
292 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.26 
 
 
296 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.28 
 
 
295 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  45.58 
 
 
294 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  40.8 
 
 
295 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  40.14 
 
 
285 aa  228  7e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.29 
 
 
292 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 
293 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.67 
 
 
294 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.3 
 
 
291 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.88 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.87 
 
 
290 aa  224  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.92 
 
 
294 aa  224  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.59 
 
 
296 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  41.01 
 
 
291 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.56 
 
 
293 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.21 
 
 
290 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.62 
 
 
290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.52 
 
 
290 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.84 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.24 
 
 
289 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  42.07 
 
 
287 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  38.97 
 
 
290 aa  218  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  38.19 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
292 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
292 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.75 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.23 
 
 
291 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  38.41 
 
 
315 aa  215  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.48 
 
 
286 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.54 
 
 
289 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
302 aa  214  9e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  39.86 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1619  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0338387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.79 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  39.1 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>