296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2028 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  72.66 
 
 
282 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  52.24 
 
 
276 aa  299  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  50.92 
 
 
275 aa  291  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  43.8 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  46.97 
 
 
273 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  44.27 
 
 
285 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  44.27 
 
 
285 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  45.2 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  37.31 
 
 
281 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
283 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
297 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  31.44 
 
 
280 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
282 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
283 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 
300 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.93 
 
 
303 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
395 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
395 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 
297 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  27.8 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 
430 aa  95.5  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  29.86 
 
 
397 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.76 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
397 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
427 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.77 
 
 
369 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29 
 
 
288 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
288 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  30 
 
 
718 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
378 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 
407 aa  85.9  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  26.19 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.67 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
544 aa  82.4  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.65 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  30.91 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  26.6 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.53 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.13 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  26.67 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.31 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.4 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.08 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.88 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.31 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  27.6 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.13 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  29.5 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  22.96 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  25.97 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  25.41 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  23.16 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.58 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  26.29 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  25.23 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  22.79 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  24.48 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>