47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1762 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  100 
 
 		 585 aa  1209    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  54.42 
 
 		 897 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  50 
 
 		 881 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  47.21 
 
 		 841 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  46.77 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  45.26 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  42.73 
 
 		 435 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  32.29 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  32.15 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  30.53 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  30.97 
 
 		 473 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  30.62 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  30.02 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  29.78 
 
 		 467 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  30.18 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  28.44 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  29.79 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  30.85 
 
 		 455 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  29.55 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  28.77 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.54 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.82 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 589 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  31.93 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.13 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3330  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.45 
 
 		 291 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0477  hypothetical protein  30.99 
 
 		 111 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.305031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.45 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.08 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4058  hypothetical protein  39.22 
 
 		 116 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.447078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4091  hypothetical protein  39.22 
 
 		 116 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  26.32 
 
 		 575 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3948  hypothetical protein  39.22 
 
 		 116 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2214  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.1 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.43 
 
 		 323 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.1 
 
 		 298 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1879  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.63 
 
 		 300 aa  44.3  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.85 
 
 		 322 aa  43.9  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.59 
 
 		 318 aa  43.9  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.16 
 
 		 322 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  25.16 
 
 		 322 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.85 
 
 		 322 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.85 
 
 		 322 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.53 
 
 		 325 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.11 
 
 		 453 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.11 
 
 		 453 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.85 
 
 		 322 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>