97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1100 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.63 
 
 
200 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.23 
 
 
203 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.39 
 
 
209 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.58 
 
 
201 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  48.13 
 
 
205 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  50.24 
 
 
200 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.24 
 
 
200 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.66 
 
 
201 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  50.48 
 
 
198 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.66 
 
 
201 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.66 
 
 
201 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.24 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.48 
 
 
228 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.24 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.76 
 
 
203 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 
230 aa  158  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  48.51 
 
 
201 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  48.02 
 
 
201 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.81 
 
 
205 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.97 
 
 
205 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.8 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.89 
 
 
201 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.8 
 
 
211 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.05 
 
 
201 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.51 
 
 
201 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  48.02 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  47.52 
 
 
201 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  47.52 
 
 
201 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  47.52 
 
 
201 aa  144  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.52 
 
 
201 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.67 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  47.03 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  51.57 
 
 
201 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.45 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.5 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  28.99 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.57 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.63 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.75 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.37 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.75 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.24 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.01 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.49 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.19 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.71 
 
 
218 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  33.64 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.88 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  26.17 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  23.53 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.95 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.22 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  24.7 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.22 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.71 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.35 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.35 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.81 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.67 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.88 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.11 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.13 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.45 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.62 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.7 
 
 
301 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.77 
 
 
215 aa  45.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.77 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.84 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.63 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.61 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.39 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  26.42 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0539  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0515  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.04 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.74 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  22.86 
 
 
222 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 
216 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
207 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  22.86 
 
 
222 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0852  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  27.56 
 
 
196 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
210 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  22.86 
 
 
222 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1931  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  31.41 
 
 
188 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.81 
 
 
246 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0700  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  28.77 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155867  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.77 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  25.65 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>