More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1337 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
343 aa  686    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  56.33 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  55.12 
 
 
350 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  51.35 
 
 
342 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  54.52 
 
 
350 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  53.24 
 
 
393 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  53.98 
 
 
355 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  54.52 
 
 
350 aa  348  6e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  54.38 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  54.38 
 
 
343 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  54.98 
 
 
344 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  53.78 
 
 
343 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  54.08 
 
 
343 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  54.08 
 
 
344 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  54.01 
 
 
356 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.29 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  55.42 
 
 
375 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  54.98 
 
 
344 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  55.22 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.12 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  51.76 
 
 
393 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  55.88 
 
 
350 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  55.56 
 
 
348 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  54.03 
 
 
368 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  51.17 
 
 
349 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  53.12 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  54.08 
 
 
344 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  54.08 
 
 
344 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  52.21 
 
 
363 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  52.84 
 
 
357 aa  328  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  51.46 
 
 
352 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  53.27 
 
 
342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  51.16 
 
 
354 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  52.54 
 
 
365 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  51.03 
 
 
345 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  50.88 
 
 
352 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  50.6 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  53.43 
 
 
378 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  49.26 
 
 
345 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  48.09 
 
 
355 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  49.71 
 
 
351 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  48.36 
 
 
354 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  54.43 
 
 
521 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  50.74 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  52.51 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  49.55 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  48.45 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  50.3 
 
 
333 aa  309  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  51.47 
 
 
358 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  49.85 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  49.25 
 
 
360 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  51.76 
 
 
358 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  51.47 
 
 
358 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  51.05 
 
 
351 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  48.07 
 
 
355 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  50.45 
 
 
351 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  49.55 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  47.79 
 
 
380 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  50.15 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  43.86 
 
 
367 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
367 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  38.49 
 
 
393 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  39.2 
 
 
396 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.26 
 
 
396 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  38.56 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
404 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
406 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  38.81 
 
 
403 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.34 
 
 
380 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.7 
 
 
380 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
380 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
381 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.05 
 
 
380 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
380 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  32.05 
 
 
380 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
380 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.07 
 
 
380 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.07 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  35.68 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  35.48 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  41.04 
 
 
390 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
416 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  41.04 
 
 
390 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
383 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
413 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
405 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>