268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0631 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0631  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
396 aa  804    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4926  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.83 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983704  normal  0.154414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4161  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.71 
 
 
358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324907 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.55 
 
 
309 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.38 
 
 
321 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0152  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.69 
 
 
392 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.693179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.32 
 
 
441 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  35.32 
 
 
441 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.35 
 
 
320 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  33.2 
 
 
323 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  28.34 
 
 
323 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  33.62 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.39 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  28.36 
 
 
313 aa  97.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.57 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  29.55 
 
 
320 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  26.06 
 
 
309 aa  93.2  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.95 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  0.106477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.78 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39453  predicted protein  26.05 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0480355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.45 
 
 
317 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.47 
 
 
328 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.46 
 
 
309 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.05 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.5 
 
 
312 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0061  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.39 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3465  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.04 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.3 
 
 
312 aa  87.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  27.21 
 
 
310 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.68 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.17 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2761  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.47 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.65 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.74 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.18 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.9 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.42 
 
 
322 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4467  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.84 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.19 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0542  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.15 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.488533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.38 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.38 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.77 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  26.85 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  28.2 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.13 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.52 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  27.94 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  23.38 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.03 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.95 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.88 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1535  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.22 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  27.03 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  27.27 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  25.19 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1105  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  29.25 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  27.12 
 
 
322 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  25.94 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.11 
 
 
324 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  26.09 
 
 
315 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  24.07 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  28.1 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.17 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2311  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.34 
 
 
303 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.933785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  27.89 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1865  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  28.88 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.23 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  27.8 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1012  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.62 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.21 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.06 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.09 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  26.96 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  27.21 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  27.12 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  27.12 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  27.78 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  27.78 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  26.47 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.69 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  26.47 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  27.78 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.8 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13427  nucleoside hydrolase iunH (purine nucleosidase)  27.25 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00808696  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  28.43 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3262  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.04 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.487952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  28.43 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.06 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  23.21 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  27.94 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  26.47 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3373  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.9 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.43 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.04 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.73 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  25.82 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  27.12 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  32.11 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>