More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0513 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  100 
 
 		 350 aa  703    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  81.92 
 
 		 343 aa  587  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  80.35 
 
 		 366 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  78.43 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  78.43 
 
 		 361 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  77.94 
 
 		 361 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  77.94 
 
 		 363 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  76.3 
 
 		 362 aa  554  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  76.88 
 
 		 364 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  77.42 
 
 		 360 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  77.74 
 
 		 362 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  77.58 
 
 		 364 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  76.01 
 
 		 363 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  75.72 
 
 		 363 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  76.3 
 
 		 362 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  76.97 
 
 		 357 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  74.86 
 
 		 362 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  77.58 
 
 		 361 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  76.7 
 
 		 355 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  79.41 
 
 		 365 aa  547  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  77.58 
 
 		 362 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  76.38 
 
 		 343 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  76.7 
 
 		 356 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  76.61 
 
 		 359 aa  545  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  76.54 
 
 		 347 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  75.36 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  74.7 
 
 		 360 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  76.88 
 
 		 363 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  76.59 
 
 		 366 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  76.59 
 
 		 366 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  76.01 
 
 		 366 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  74.17 
 
 		 357 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  77.41 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  76.38 
 
 		 357 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  75.14 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  74.7 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  75.54 
 
 		 345 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  75.54 
 
 		 345 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  74.54 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  72.9 
 
 		 345 aa  501  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  72.46 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  71.74 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  75.38 
 
 		 379 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  70.96 
 
 		 362 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  69.48 
 
 		 363 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  71.74 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  68.6 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  69.97 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  69.36 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  70.72 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  68.21 
 
 		 349 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  72.5 
 
 		 344 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  67.93 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  74.23 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  69.91 
 
 		 345 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  67.92 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.12 
 
 		 336 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  70.27 
 
 		 364 aa  490  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  68.42 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  70.59 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  68.96 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  71.09 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  71.43 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.86 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  69 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  70.81 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  70.81 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  69.82 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  71.69 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  71.12 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  70.5 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  73.56 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  70.99 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  69.28 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  69.85 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  72.26 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  73.56 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  71.95 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  69.57 
 
 		 349 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  69.88 
 
 		 355 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  70.77 
 
 		 352 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  67.35 
 
 		 345 aa  484  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69.51 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  71.65 
 
 		 356 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  69.72 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  69.88 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  69.88 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.65 
 
 		 356 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  69.88 
 
 		 355 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.65 
 
 		 356 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  73.56 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  66.76 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  71.65 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  71.65 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  67.63 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  71.04 
 
 		 359 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  69.88 
 
 		 355 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  71.65 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  66.76 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  67.87 
 
 		 350 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>