More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0347 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  61.51 
 
 		 301 aa  351  8e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  53.95 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  55.95 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 		 301 aa  309  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  56.35 
 
 		 309 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  54.46 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  54.46 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  55.88 
 
 		 308 aa  304  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 		 310 aa  301  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  52.32 
 
 		 302 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  50.96 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 		 306 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  53.18 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  49.5 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  52.35 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  48.85 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  48.55 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  48.1 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  49.68 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  50.48 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  47.42 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 327 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  48.51 
 
 		 311 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  48.26 
 
 		 327 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  49.21 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  47.44 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  46.65 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  47.98 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  47.95 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  47.83 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 		 312 aa  261  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  48.29 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  45.95 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  49.2 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  48.43 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  48.74 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  45.81 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  48.39 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 308 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  47.81 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  47.81 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  51 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  49.31 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  48.24 
 
 		 314 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  50.31 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  49.69 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  51.04 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  48.91 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  49.33 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  44.19 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  48.91 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  44.18 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  46.08 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>