45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3095 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 245 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  47.76 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  45.78 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  44.58 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  46.46 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  43.93 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  43.7 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  43.62 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  43.62 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  43.62 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  41.35 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  41.84 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  40.24 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  40.87 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  40.56 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  36.73 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  35.92 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  39.68 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  39.36 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  36.84 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  38.15 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  41.67 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  38.46 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  35.44 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  38.31 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  35.92 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  32.77 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  35.98 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  33.48 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  37.45 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  35.42 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  35.54 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.94 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.68 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  47.3 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.42 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  24.1 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  24.4 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.98 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  23.73 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  22.32 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.53 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.11 
 
 		 524 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  27.11 
 
 		 524 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>