200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2490 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  51.44 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  41.31 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  41.41 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  41.02 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  41.02 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  40.32 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  40.29 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  34.24 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  34.12 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  34.12 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  34.12 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 		 680 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  33.33 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  32.48 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  27.94 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.41 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.12 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 1037 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.37 
 
 		 684 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.63 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 1027 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 1027 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 1180 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.77 
 
 		 584 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 		 1027 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 1142 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.78 
 
 		 1094 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.55 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  25.84 
 
 		 441 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 		 1156 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 		 612 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  36.17 
 
 		 607 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.66 
 
 		 595 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.9 
 
 		 637 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.14 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.73 
 
 		 575 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  26.05 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.11 
 
 		 738 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  28.99 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 		 1160 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.14 
 
 		 665 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.21 
 
 		 1053 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  30.07 
 
 		 424 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.37 
 
 		 1055 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.28 
 
 		 577 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 		 468 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 369 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.37 
 
 		 568 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 1148 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.8 
 
 		 643 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.3 
 
 		 598 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  27.07 
 
 		 1172 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  26.36 
 
 		 465 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  25.84 
 
 		 431 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  30.07 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 1151 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 1151 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.82 
 
 		 1014 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 546 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2267  putative adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 		 703 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  25.31 
 
 		 463 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 1392 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  28.08 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  27.03 
 
 		 518 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  25.31 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 		 1198 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 468 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 		 1050 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  28.3 
 
 		 411 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.93 
 
 		 643 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.18 
 
 		 1050 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  25.63 
 
 		 645 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 		 526 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  38.54 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  31.16 
 
 		 1358 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 357 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.88 
 
 		 611 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>