More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1221 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 349 aa  689    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  69.8 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  62.38 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  50.25 
 
 		 285 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  49.75 
 
 		 272 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  47.25 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  47.42 
 
 		 260 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  46.46 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  47.49 
 
 		 261 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  45.45 
 
 		 312 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  51.38 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  42.25 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  45.54 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  46.01 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  44.6 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  42.44 
 
 		 237 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  41.95 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  40.38 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  42.03 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  40.19 
 
 		 265 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  44.44 
 
 		 267 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  41.55 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  41.55 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  41.55 
 
 		 254 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  40.1 
 
 		 265 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  39.29 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  39.9 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  39.58 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  39.81 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  38.94 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  38.83 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  38.94 
 
 		 270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  38.83 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  38.94 
 
 		 270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  42.86 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  38.83 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  38.02 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  38.02 
 
 		 269 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  38.02 
 
 		 266 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  38.02 
 
 		 266 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  38.02 
 
 		 266 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  38.89 
 
 		 265 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  37.23 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  37.23 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  39.79 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  39.27 
 
 		 270 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  38.3 
 
 		 250 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  36.92 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  40.84 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  34.9 
 
 		 256 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  35.42 
 
 		 257 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  39.29 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  39.29 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  39.29 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  35.94 
 
 		 255 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  38.12 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  38.46 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  35 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35 
 
 		 251 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  32.8 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  35.08 
 
 		 264 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  37.97 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  32.28 
 
 		 250 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  35.98 
 
 		 249 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  35.06 
 
 		 249 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  34.86 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  41.15 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  32.95 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.55 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  31.75 
 
 		 255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  37.17 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.25 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  30.37 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1239  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  29.95 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  32.8 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  34.98 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  32.12 
 
 		 257 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  35.8 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  30.89 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  32.37 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  32.8 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  29.47 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.36 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  27.51 
 
 		 261 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  36.02 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  36.67 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.34 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  31.36 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  35.56 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  37.22 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  27.43 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  29.1 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>