More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0622 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  41.76 
 
 
1457 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  47.77 
 
 
2350 aa  869    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  40.1 
 
 
2057 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  51.2 
 
 
1163 aa  955    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  38.74 
 
 
2230 aa  779    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  48.47 
 
 
2174 aa  876    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  43.81 
 
 
2258 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  35.84 
 
 
1193 aa  665    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  49.12 
 
 
1167 aa  978    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  42.75 
 
 
1501 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  51.65 
 
 
1131 aa  1068    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  48.98 
 
 
1414 aa  968    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  42.16 
 
 
1469 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  42.06 
 
 
2035 aa  735    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  43.91 
 
 
1463 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1174 aa  2308    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  42.37 
 
 
1457 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  49.37 
 
 
1167 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  43.18 
 
 
1489 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  46.74 
 
 
2310 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.47 
 
 
1113 aa  774    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  42.37 
 
 
1457 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  49.37 
 
 
1167 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  47.8 
 
 
1149 aa  921    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  48.69 
 
 
1678 aa  993    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  47.91 
 
 
1152 aa  946    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  40.78 
 
 
2200 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  41.24 
 
 
1438 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  33.37 
 
 
1497 aa  619  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  40.79 
 
 
1436 aa  619  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  45.18 
 
 
1511 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  39.96 
 
 
4165 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.4 
 
 
3252 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  35.2 
 
 
3293 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  34.02 
 
 
1157 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  33.99 
 
 
1157 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  35.98 
 
 
3194 aa  596  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  41.86 
 
 
2006 aa  592  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  35.14 
 
 
3875 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  41.63 
 
 
1835 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.92 
 
 
1487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  32.53 
 
 
1514 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  41.3 
 
 
1734 aa  576  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  34.7 
 
 
3739 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  40.27 
 
 
4268 aa  563  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  38.34 
 
 
2619 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.79 
 
 
3021 aa  556  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  38.4 
 
 
1317 aa  552  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  30.08 
 
 
2336 aa  549  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.51 
 
 
3002 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  34.89 
 
 
1862 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.03 
 
 
2345 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  40.09 
 
 
1884 aa  546  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  29.87 
 
 
2338 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  36.24 
 
 
1897 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  37.65 
 
 
2706 aa  542  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  40.95 
 
 
1845 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  34.91 
 
 
1104 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  40.08 
 
 
1837 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  35.89 
 
 
1888 aa  532  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  37.76 
 
 
1321 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  32.94 
 
 
1042 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  35.82 
 
 
1084 aa  515  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  34.76 
 
 
2896 aa  516  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  34.15 
 
 
1158 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  38.85 
 
 
2084 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  38.65 
 
 
2090 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  38.74 
 
 
2023 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  38.66 
 
 
1825 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  38.3 
 
 
1825 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  38.3 
 
 
1825 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  39 
 
 
1894 aa  492  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  31.5 
 
 
1837 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  37.16 
 
 
1824 aa  483  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  37.68 
 
 
1809 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  36.84 
 
 
1809 aa  482  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  38.61 
 
 
1326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  31.02 
 
 
1889 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.61 
 
 
1699 aa  439  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  26.35 
 
 
3374 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.21 
 
 
4531 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  29.82 
 
 
1405 aa  350  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  27.02 
 
 
3308 aa  347  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 
4090 aa  346  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.15 
 
 
6676 aa  344  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.07 
 
 
6889 aa  338  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.32 
 
 
4991 aa  336  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.17 
 
 
4502 aa  335  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  30.42 
 
 
3291 aa  334  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  41.33 
 
 
1567 aa  333  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  41.5 
 
 
1567 aa  332  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  30.28 
 
 
3348 aa  331  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  23.96 
 
 
2439 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  32.42 
 
 
1574 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  41.17 
 
 
1567 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  26.84 
 
 
1553 aa  328  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.83 
 
 
5149 aa  327  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 
3432 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  29.74 
 
 
3650 aa  326  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  30.43 
 
 
1334 aa  324  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>