68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2545 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  991    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  87.47 
 
 		 478 aa  878    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  52.29 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  50.51 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  48.03 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  39.36 
 
 		 522 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  40.26 
 
 		 517 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  39.85 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  38.71 
 
 		 517 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  39.02 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  55.21 
 
 		 700 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  39.31 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  71.2 
 
 		 697 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  70.53 
 
 		 649 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  34.24 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  34.24 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  36.5 
 
 		 660 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  48.94 
 
 		 521 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  48.94 
 
 		 521 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  29.1 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  30.88 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  45.08 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  32.36 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  33.33 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  32.74 
 
 		 544 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  31.55 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  30.7 
 
 		 599 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  29.41 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  40.61 
 
 		 724 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  42.33 
 
 		 522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  42.25 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  44.9 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  40.62 
 
 		 522 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  39.18 
 
 		 638 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  43.01 
 
 		 512 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  28.36 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  43.85 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  43.01 
 
 		 1117 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.86 
 
 		 569 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  42.93 
 
 		 821 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  39.18 
 
 		 781 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  29.51 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  41.36 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  41.58 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  33.6 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  35.6 
 
 		 690 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  33.66 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  30.26 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  33.63 
 
 		 802 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  27.51 
 
 		 585 aa  113  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  33.33 
 
 		 644 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  30.77 
 
 		 734 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  32.26 
 
 		 686 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  30.81 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  30.81 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  29.73 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.04 
 
 		 740 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  26.98 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  24.49 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  29.7 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  24.6 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  33.67 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  29.7 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  29.7 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  28.97 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  24.43 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  24.43 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  24.74 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>