More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2119 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2119  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2099  response regulator receiver  92.37 
 
 		 131 aa  227  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.003608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3414  response regulator receiver domain-containing protein  43.85 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  44.8 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  39.84 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  42.62 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  40.3 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  44.54 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  39.68 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  40 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  40.18 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5237  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 153 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  34.19 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  34.92 
 
 		 1374 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  35.83 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  31.67 
 
 		 2301 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0963  response regulator  29.84 
 
 		 441 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  34.75 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1159 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1145 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1038 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1141 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>