43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1835 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  37.16 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  33.52 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  36.11 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  33.52 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  35.24 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  35.54 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  33.82 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  31.93 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  33.7 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  33.7 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  33.7 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  33.7 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  33.7 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  33.7 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  34.19 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  36.7 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  29.39 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  24.86 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.86 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  47.17 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  25.71 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  44.64 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  44.64 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  44.64 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  44.64 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  31 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  22.95 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3014  hypothetical protein  62.5 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  33.73 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  47.06 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  27.18 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  28.78 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  27.85 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  27.85 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27.5 
 
 		 461 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  47.62 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  47.62 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  28.76 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  39.22 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.85 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  30.65 
 
 		 602 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>