More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1856 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  77.64 
 
 
620 aa  946    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  77.96 
 
 
611 aa  963    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  77.64 
 
 
620 aa  979    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  77.48 
 
 
620 aa  978    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  77.48 
 
 
620 aa  978    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  55.21 
 
 
648 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  77.96 
 
 
611 aa  964    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  77.16 
 
 
620 aa  972    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  77.64 
 
 
620 aa  978    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  80.74 
 
 
619 aa  1004    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  77.48 
 
 
620 aa  978    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
623 aa  1242    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  77.64 
 
 
620 aa  977    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  77.8 
 
 
620 aa  978    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  52.55 
 
 
644 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  51.4 
 
 
657 aa  621  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  52.72 
 
 
644 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  52.88 
 
 
644 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  52.88 
 
 
647 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  52.88 
 
 
647 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  52.88 
 
 
647 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  52.38 
 
 
644 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  54.1 
 
 
661 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  52.39 
 
 
644 aa  616  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  52.88 
 
 
644 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  52.88 
 
 
644 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  52.88 
 
 
644 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  51.06 
 
 
654 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  50 
 
 
662 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  50 
 
 
662 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  49.84 
 
 
662 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  50.51 
 
 
641 aa  578  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  51.35 
 
 
615 aa  578  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  50.43 
 
 
641 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  47.32 
 
 
657 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  47.09 
 
 
657 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  50.81 
 
 
583 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  50.18 
 
 
594 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  45.11 
 
 
659 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  45.68 
 
 
659 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  45.29 
 
 
662 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  45.37 
 
 
665 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.37 
 
 
665 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  45.65 
 
 
668 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  49.19 
 
 
582 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.65 
 
 
668 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  50.67 
 
 
594 aa  505  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  45.62 
 
 
668 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.72 
 
 
668 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  50.29 
 
 
581 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3969  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  46.03 
 
 
668 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873179  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00008  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.89 
 
 
666 aa  505  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
574 aa  502  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.62 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0195  ubiquinol oxidase, subunit I  44.77 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3794  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.95 
 
 
658 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622698  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1567  ubiquinol oxidase, subunit I  44.77 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 
589 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0992  ubiquinol oxidase, subunit I  44.84 
 
 
668 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.502961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  48.23 
 
 
590 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1787  ubiquinol oxidase, subunit I  45.16 
 
 
670 aa  502  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1547  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.17 
 
 
667 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557113  normal  0.218021 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0043  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.37 
 
 
659 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3171  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.03 
 
 
666 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.404396  normal  0.0592526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.41 
 
 
665 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115333  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  51.56 
 
 
743 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0226  ubiquinol oxidase, subunit I  44.77 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  45.88 
 
 
663 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  45.62 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.35 
 
 
659 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1876  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.01 
 
 
667 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178769  normal  0.179376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  45.62 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  49.82 
 
 
567 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  48.82 
 
 
593 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1370  ubiquinol oxidase, subunit I  44.77 
 
 
668 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.262769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000524598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000236873  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  49.55 
 
 
581 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0043  ubiquinol oxidase subunit I  44.37 
 
 
659 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  46.92 
 
 
566 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  48.45 
 
 
596 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  44.12 
 
 
664 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000517017  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2715  ubiquinol oxidase, subunit I  44.68 
 
 
668 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0985139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0480  ubiquinol oxidase, subunit I  44.28 
 
 
668 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.070383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  44.75 
 
 
669 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  44.46 
 
 
659 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  49.73 
 
 
581 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  47.72 
 
 
580 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000135927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0515  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054228  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  48.38 
 
 
589 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00386  hypothetical protein  45.6 
 
 
663 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.43 
 
 
669 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  49.73 
 
 
581 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2266  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  44.7 
 
 
668 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  51.43 
 
 
581 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1274  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  42.05 
 
 
672 aa  498  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000601159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>