More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2623 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  62.86 
 
 
251 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  61.98 
 
 
251 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.57 
 
 
251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  61.57 
 
 
251 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  61.16 
 
 
251 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  61.16 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  61.16 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  61.16 
 
 
251 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  60.74 
 
 
287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  52.36 
 
 
285 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  53.33 
 
 
281 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  52.92 
 
 
281 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  52.92 
 
 
281 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  52.94 
 
 
288 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
255 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  52.63 
 
 
298 aa  261  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.32 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  53.68 
 
 
286 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  51.57 
 
 
265 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  53.22 
 
 
281 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.41 
 
 
281 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  49.6 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  51.45 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  51.27 
 
 
261 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  51.27 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.38 
 
 
271 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  50.42 
 
 
287 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  52.46 
 
 
291 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 
284 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  51.08 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.67 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  50.85 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  48.77 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  47.74 
 
 
269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.57 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.7 
 
 
253 aa  235  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  47.7 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 
286 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.48 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  46.8 
 
 
267 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50 
 
 
261 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
255 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 
261 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.1 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.32 
 
 
274 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.88 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.66 
 
 
304 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.9 
 
 
260 aa  228  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 
232 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.5 
 
 
253 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  47.28 
 
 
245 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 
264 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
308 aa  226  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  44.57 
 
 
315 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50 
 
 
252 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 
259 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.28 
 
 
256 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  45.92 
 
 
262 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
260 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.4 
 
 
271 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.49 
 
 
253 aa  225  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  45.96 
 
 
265 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.14 
 
 
303 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.14 
 
 
303 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.03 
 
 
307 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
260 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.52 
 
 
263 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.15 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.14 
 
 
303 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 
271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  44.3 
 
 
257 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  48.29 
 
 
276 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.73 
 
 
304 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.55 
 
 
254 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  44.76 
 
 
252 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
271 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
267 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
278 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.73 
 
 
304 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  49.36 
 
 
261 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.17 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.2 
 
 
259 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.4 
 
 
274 aa  222  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
267 aa  221  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.47 
 
 
259 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  44.59 
 
 
247 aa  221  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
281 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.35 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.09 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.09 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.38 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.15 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>