27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0922 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  77.13 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  81.66 
 
 		 182 aa  290  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  80.84 
 
 		 167 aa  286  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  62.5 
 
 		 202 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  70.8 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  71.53 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.48 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  53.08 
 
 		 140 aa  157  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  56.45 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  52.8 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  54.1 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  42.4 
 
 		 130 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  44.53 
 
 		 133 aa  111  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  46.83 
 
 		 135 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  43.8 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  42.15 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.98 
 
 		 130 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 130 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  42.15 
 
 		 134 aa  92  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 		 133 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 130 aa  88.2  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  36.94 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  32.79 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2691  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.4 
 
 		 501 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0450701 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 103 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>