More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3052 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 		 242 aa  493  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  74.18 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  64.08 
 
 		 244 aa  322  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  57.89 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  58.85 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  50.57 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  57.61 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  42.75 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  39.04 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  40.15 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  36.17 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  36.3 
 
 		 269 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.38 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.03 
 
 		 263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.74 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.21 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  38.34 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.3 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  38.34 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  36.76 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  42.04 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.31 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.06 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.26 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.36 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.51 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  37.4 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  37.5 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  39.54 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  37.5 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  36.6 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.76 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  35.97 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  35.97 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  35.97 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  38.75 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  36.11 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  36.76 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  37.85 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.85 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  35.02 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  36.92 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.22 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  37.79 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.15 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  37.88 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  38.67 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.64 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  36.15 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.85 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.85 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  37.64 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  36.89 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  35.5 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  37.45 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  37.88 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.38 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.38 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.02 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.25 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  37.8 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  36.6 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  37.21 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  33.88 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  37.89 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.75 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  36.47 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  34.75 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.74 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  35.88 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.05 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  36.19 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  37.65 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.35 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  36.88 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  39 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  37.02 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  37.02 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  38.22 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  36.64 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  38.65 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  38.65 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>