More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2761 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  100 
 
 		 517 aa  1023    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  70.02 
 
 		 516 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  82.98 
 
 		 518 aa  840    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  61.66 
 
 		 519 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  63.06 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  60.71 
 
 		 519 aa  589  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.73 
 
 		 530 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.29 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 		 525 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  52.33 
 
 		 536 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  56.45 
 
 		 543 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  54.48 
 
 		 534 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  54.1 
 
 		 546 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  51.83 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  49.34 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 566 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  49.81 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  49.62 
 
 		 532 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  41.15 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  50.76 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  42.91 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.4 
 
 		 532 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  43.53 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  46.14 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  43.18 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 546 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  42.54 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  49.3 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  37.75 
 
 		 700 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  40.08 
 
 		 602 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  39.85 
 
 		 798 aa  335  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.8 
 
 		 640 aa  335  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  39.25 
 
 		 668 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.83 
 
 		 591 aa  283  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.65 
 
 		 585 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  37.4 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 		 567 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 574 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.22 
 
 		 559 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 		 569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 583 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 573 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 639 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 600 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.38 
 
 		 567 aa  256  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.06 
 
 		 529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 584 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 575 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 559 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.81 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 595 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 568 aa  250  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 579 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  32.5 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 582 aa  246  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 559 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 577 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.26 
 
 		 554 aa  243  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 572 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.64 
 
 		 557 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.84 
 
 		 557 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 560 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.84 
 
 		 573 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.45 
 
 		 560 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.52 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.52 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.52 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.33 
 
 		 560 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 		 583 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 582 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 522 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.33 
 
 		 560 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>