272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2250 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2250  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
359 aa  736    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.07 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0361  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.87 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  23.36 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.59 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0498  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.36 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0148248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.13 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.22 
 
 
935 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.4 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  21.74 
 
 
431 aa  60.5  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
390 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.65 
 
 
446 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
374 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
335 aa  59.3  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
387 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  23.48 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.4 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0191  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
364 aa  57  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
394 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
414 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
904 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
710 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.29 
 
 
769 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.51 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.72 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.08 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
711 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
370 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  21.86 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
476 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
438 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
423 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
395 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  30 
 
 
426 aa  52.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  22.19 
 
 
364 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.5 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  25.64 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  21.87 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  35.71 
 
 
350 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50490  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol (GPI) biosynthetic protein  25.1 
 
 
444 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
366 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
379 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  34.23 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 
392 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  20.22 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2082  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
384 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
396 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0797  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
337 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
391 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.07 
 
 
440 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  33.75 
 
 
745 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.59 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.86 
 
 
444 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  24.91 
 
 
783 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
413 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  21.1 
 
 
398 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  34.12 
 
 
363 aa  49.7  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>