More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1620 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  100 
 
 		 708 aa  1449    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  46.82 
 
 		 714 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  49.16 
 
 		 711 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  51.12 
 
 		 711 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  47.47 
 
 		 730 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  51.12 
 
 		 711 aa  704    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  46.78 
 
 		 712 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  47.56 
 
 		 712 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  44.28 
 
 		 717 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  44.52 
 
 		 717 aa  631  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  44.66 
 
 		 717 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  44.46 
 
 		 713 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  46.85 
 
 		 721 aa  622  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  44.38 
 
 		 716 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  43.82 
 
 		 716 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  43.89 
 
 		 710 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  42.84 
 
 		 767 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.61 
 
 		 722 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  33.24 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  39.45 
 
 		 473 aa  319  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  42.26 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  42.52 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.98 
 
 		 470 aa  317  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  37 
 
 		 469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  39.65 
 
 		 470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  37.31 
 
 		 470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  37.09 
 
 		 479 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.09 
 
 		 470 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  40.22 
 
 		 470 aa  314  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  37 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  37.42 
 
 		 469 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  39.56 
 
 		 489 aa  313  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  42.08 
 
 		 481 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  36.56 
 
 		 470 aa  313  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  41.73 
 
 		 481 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  33 
 
 		 741 aa  312  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  41.69 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.73 
 
 		 470 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  41.35 
 
 		 474 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  36.68 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  36.73 
 
 		 470 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  36.68 
 
 		 470 aa  308  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.73 
 
 		 470 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  38.26 
 
 		 472 aa  308  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  36.5 
 
 		 470 aa  308  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 470 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  41.08 
 
 		 480 aa  307  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  37.44 
 
 		 471 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  36.5 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  37 
 
 		 471 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  36.46 
 
 		 470 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  36.59 
 
 		 480 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  36.46 
 
 		 470 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  36.24 
 
 		 470 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.7 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  37.75 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  41.01 
 
 		 481 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  40.11 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.61 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 		 479 aa  301  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  38.48 
 
 		 480 aa  300  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  37.85 
 
 		 480 aa  300  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  31.45 
 
 		 727 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  40.16 
 
 		 479 aa  298  3e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  39.9 
 
 		 479 aa  296  7e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  40 
 
 		 456 aa  296  9e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  30.85 
 
 		 741 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  39.37 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  37.45 
 
 		 494 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  39.26 
 
 		 477 aa  295  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  36.61 
 
 		 482 aa  294  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  36.09 
 
 		 501 aa  294  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.9 
 
 		 483 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.9 
 
 		 483 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  35.9 
 
 		 483 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  35.9 
 
 		 483 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35.9 
 
 		 536 aa  294  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  36.82 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  35.9 
 
 		 483 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  41.62 
 
 		 496 aa  293  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  35.9 
 
 		 483 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  36.72 
 
 		 481 aa  293  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  38.3 
 
 		 471 aa  293  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  37.2 
 
 		 493 aa  291  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  37.2 
 
 		 493 aa  291  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  40.17 
 
 		 492 aa  290  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  37.74 
 
 		 473 aa  289  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  39.01 
 
 		 479 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  38.98 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  39.1 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  35.32 
 
 		 463 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  36.74 
 
 		 490 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.21 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  29.61 
 
 		 812 aa  286  7e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  36.88 
 
 		 476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  38.21 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  37.39 
 
 		 477 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  37.39 
 
 		 482 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  36.58 
 
 		 475 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>