255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1614 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  80.6 
 
 
134 aa  233  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  74.81 
 
 
132 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  61.94 
 
 
134 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  61.54 
 
 
132 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  59.4 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  57.69 
 
 
133 aa  155  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  57.25 
 
 
133 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  39.67 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  35.16 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  39.83 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  37.17 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  36.07 
 
 
124 aa  84.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06185  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 
493 aa  82.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0429141 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  32.79 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  37.39 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  31.13 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  34.21 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  34.4 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  37.63 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  32.81 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  30.58 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  32.8 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  33.9 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  31.86 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  31.09 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  30.91 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  30.97 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  30.97 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  28.24 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  29.37 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  26.02 
 
 
537 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  29.84 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  31.45 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.91 
 
 
711 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  31.45 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  32.06 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  31.62 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  27.61 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  27.34 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  31.5 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  28.07 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  31.86 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  29.01 
 
 
700 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0846  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 
137 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  27.68 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.53 
 
 
695 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.5 
 
 
703 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  29.82 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  35.87 
 
 
705 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.35 
 
 
696 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  26.02 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
707 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  30.7 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  32.17 
 
 
612 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  25.42 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  24.56 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  26.61 
 
 
669 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.12 
 
 
714 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  30.08 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  32.56 
 
 
688 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  27.37 
 
 
697 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
711 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  26.92 
 
 
707 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  36.26 
 
 
660 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
712 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.26 
 
 
702 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  25.2 
 
 
701 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
702 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  27.5 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.89 
 
 
699 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
451 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0916  CoA-binding domain-containing protein  24.24 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.7124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  29.09 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  27.64 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  29.32 
 
 
887 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  24 
 
 
660 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  25.2 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  27.83 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  34.45 
 
 
138 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  25.2 
 
 
140 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  24.03 
 
 
680 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  32.8 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
706 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  25.2 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.18 
 
 
915 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  25.4 
 
 
687 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
893 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>