105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1550 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  100 
 
 		 67 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  85.07 
 
 		 67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  87.88 
 
 		 67 aa  116  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  81.82 
 
 		 67 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  87.88 
 
 		 67 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  86.36 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  86.36 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  86.36 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  84.85 
 
 		 67 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  86.15 
 
 		 71 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  84.62 
 
 		 66 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  77.61 
 
 		 67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  77.61 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  80.6 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  83.08 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  83.08 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  78.12 
 
 		 67 aa  106  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  76.12 
 
 		 68 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  74.63 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  77.27 
 
 		 76 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  74.6 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  73.44 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  62.69 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  64.71 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  67.19 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  73.02 
 
 		 73 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  70.77 
 
 		 74 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  63.24 
 
 		 68 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  64.06 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  57.97 
 
 		 76 aa  83.6  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  68.25 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  57.58 
 
 		 72 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  56.06 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  60.29 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  54.79 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  53.03 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  53.12 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  50.82 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  50 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  49.3 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  55.56 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  50.7 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  47.22 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  47.89 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  48.28 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  39.71 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  44.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  28.36 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1700  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  36.76 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  43.1 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  41.38 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.33 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  42.19 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  44.83 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  36.84 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  31.82 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  37.93 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.66 
 
 		 69 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  32.26 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  41.38 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 		 63 aa  40.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>