More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1408 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.86 
 
 		 295 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.19 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.82 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.19 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  60.54 
 
 		 416 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  57.63 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  52.11 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  58.85 
 
 		 285 aa  298  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  56.13 
 
 		 401 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  56.92 
 
 		 471 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  56.05 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  55.16 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  53.94 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  50.36 
 
 		 415 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  56.05 
 
 		 293 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  54.26 
 
 		 301 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.47 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  49.82 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  47.96 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  54.44 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.19 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  55.86 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  52.85 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  49.44 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  51.47 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  49.42 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  48.29 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  47.35 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  46.74 
 
 		 297 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  49.03 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  46.59 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.21 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.33 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  48.63 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  45.02 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  51.18 
 
 		 341 aa  248  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.59 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.21 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  47.56 
 
 		 265 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  46.9 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  46.04 
 
 		 278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.98 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.83 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  47.27 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  48.91 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  46.01 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  48.25 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  51.81 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.29 
 
 		 378 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  47.29 
 
 		 375 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  45.66 
 
 		 358 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  45.66 
 
 		 358 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.57 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  45.6 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.06 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  44.36 
 
 		 349 aa  224  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.97 
 
 		 353 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  46.4 
 
 		 368 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.97 
 
 		 353 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.96 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.98 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  48.24 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  48.99 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.49 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  46.31 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.88 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  46.9 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  46 
 
 		 359 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  47.37 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  41.03 
 
 		 367 aa  218  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  48.02 
 
 		 358 aa  218  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.35 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  48.22 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  44.76 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.66 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  47.41 
 
 		 351 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  44.49 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.06 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.94 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  44.32 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  47.22 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.55 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  42.21 
 
 		 367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  44.79 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  44.4 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  44.14 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  45.28 
 
 		 364 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  44.57 
 
 		 361 aa  215  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  45.14 
 
 		 374 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.37 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.1 
 
 		 415 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.16 
 
 		 367 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  45.6 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3248  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.21 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.31 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  45.53 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  48.62 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  43.28 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>