32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0970 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  100 
 
 		 983 aa  1961    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1241 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  48.98 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  41.92 
 
 		 690 aa  290  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  39.9 
 
 		 607 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  34.99 
 
 		 1323 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  34.32 
 
 		 568 aa  187  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  29.65 
 
 		 642 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  30.43 
 
 		 587 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  31.84 
 
 		 587 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  26.89 
 
 		 635 aa  130  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  26.34 
 
 		 653 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  29.78 
 
 		 524 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  56.25 
 
 		 138 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  49.48 
 
 		 913 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  28.4 
 
 		 550 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  45.74 
 
 		 888 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  47.22 
 
 		 2042 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  43.42 
 
 		 1804 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  37.89 
 
 		 898 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  36.17 
 
 		 899 aa  65.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  45.95 
 
 		 937 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1902 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  42.11 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  47.54 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  40 
 
 		 1439 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  38.24 
 
 		 694 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  43.33 
 
 		 2192 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.32 
 
 		 1547 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  25.09 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  37.14 
 
 		 696 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  36.62 
 
 		 1047 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>